【佳学基因检测】什么是MLPA基因检测？有什么优点？

什么是MLPA基因检测？

MLPA(多重连锁依赖探针扩增)是一种分子生物学技术,用于检测基因组中的缺失或重复片段。它主要用于检测与遗传性疾病相关的基因缺失或重复。

MLPA检测的主要步骤包括:

设计特异性探针:针对目标基因及其临近区域设计多个探针,每个探针能与特定DNA序列结合。DNA变性和探针杂交:将genomic DNA变性,使之成为单链状态,然后与探针混合,让探针与目标DNA序列结合。

连锁探针:探针之间通过一种特殊的连锁反应连接在一起。

PCR扩增:使用通用引物进行PCR扩增,扩增的产物大小与目标区域探针数量相关。

电泳或基因测序分析:通过检测扩增产物的分子量或序列来判断目标基因是否存在缺失或重复情况。

MLPA技术具有较高的准确性和敏感性,可以快速有效地检测出基因组中的缺失或重复突变。它常被用于产前诊断、遗传咨询及肿瘤基因分析等领域。相比于一些其他常规技术,MLPA检测成本较低、流程较快捷。

为什么选择MLPA?

拷贝数变异(CNVs)在数百种遗传性疾病中起作用,即使是最罕见的疾病,也有现成的MLPA检测方法。世界各地的实验室都使用MLPA来确保足够识别基因缺失和重复。对于CNVs构成大部分突变的疾病,MLPA被用作一线检测手段。同样地,对于那些遗传分析受假基因干扰的疾病,由于MLPA能够出色地区分高度相似的序列,因此被用于检测。在癌症基因组学领域,MLPA被用于研究体细胞CNVs,以优化肿瘤分型。

MLPA用于一线筛查

杜桥氏肌营养不良症(DMD)

MLPA探针混合物P034和P035 DMD的组合使用,长期以来一直是DMD筛查的一线检测手段。由于大约70%的DMD CNVs可以通过P034-P035检测到,因此使用它们可以简化和流程化CNV的鉴定。

脊髓性肌肉萎缩症(SMA)

SMA是由SMN1基因缺失引起的。MLPA是少数几种能可靠定量SMN1的技术之一,因为它能准确区分SMN1与高度相似的SMN2基因之间仅有的一个临床相关的核苷酸差异。MLPA探针混合物P021 SMA和P060 SMA Carrier被认为是SMA筛查的金标准。

MLPA作为补充检测

对于许多疾病,CNVs虽然只占一小部分但却是重要的致病基因改变。例如,遗传性乳腺癌和卵巢癌,全球范围内都使用MLPA探针混合物P002 BRCA1和P045 BRCA2来鉴定相关的缺失和重复。

MLPA在肿瘤分型中的应用

使用特殊的药物方案可以改善癌症患者的预后。MGMT-IDH1-IDH2特异性MLPA探针混合物可用于确定MGMT启动子的甲基化状态和四种最常见的IDH1/IDH2点突变的存在情况。这有助于正确分类中枢神经系统肿瘤,帮助医生制定最佳的治疗计划。