CIViC数据平台的全称
CIViC数据平台的全称是:Clinical Interpretation of Variants in Cancer。翻译成中文就是癌症基因序列变化的临床解释。CIViC是一个由肿瘤基因解码专家共同搭建的一个开放的网络平台。
为什么要建立CIViC网络数据平台?
精确医学是指根据每个个体及其疾病的独特特点,来选择和设计预防、干预和治疗策略。对于癌症来说,不同的癌症患者个有不同的肿瘤驱动基因,有不同的突变组合,每一个患者可能因为存在特定的突变,从而对化 疗药物及靶向药物存在着不同的的反应,从面产生不同的治疗效果。由于关于肿瘤的基因解码研究快速发展,而基因检测结果的准确与否、以及如何选择更更多的基因位点进行检测需要依赖对各种突变序列的解释。但是由于研究文献杂乱而分散,而且研究和分析结果主要存在于各个机构的数据库中,从而浪费大量的人力、物力,做着重复性的工作。建立CIViC平台的目的,就是集中基因信息解码生态圈的资源,共同对癌症中的基因序列变化进行注释、讨论、和应用。并且通过这个平台传播基因对癌症的发生、治疗的知识。推进精准医学的发展。
如何访问CIViC网络数据平台?
截至到2020年2月:CIViC平台的网址是:https://civicdb.org/about。 大家点击链接即可访问这一公开网络资源。
参与CIViC网络数据平台的都有哪些牛人?
使用CIViC平台的都有哪些机构?
目前使用CIViC数据平台有有很多全球性的大公司和国际知名研究机构。
- Agilent's Alissa Clinical Informatics Platform
- Biogazelle
- BioGPS
- Cambridgene
- CancerStop Android Application
- CBioPortal
- CIViCmine
- DAPHNI – A platform for precision medicine of multiple myeloma
- Database of Curated Mutations (DoCM)
- ETH Nexus Personalized Health Technologies - Swiss Variant Interpretation Platform for Oncology
- Euformatics OmnomicsNGS
- Gemini
- Gene Cards
- Genoox
- GoldenHelix - VSClinical
- Google BigQuery
- International Cancer Genome Consortium (ICGC) Data Portal
- LifeMap Sciences TGex NGS Analysis & Interpretation Platform
- Medical Genomics Japan Variant Database (MGeND)
- Microsoft Research - Natural Language Processing
- MolecularMatch
- Monarch Initiative (via Wikidata)
- My Variant Info
- Monarch Iniative SEPIO - Scientific Evidence and Provenance Information Ontology
- NDEx - The Network Data Exchange
- OncoMX
- PathOS - Peter MacCallum Cancer Centre
- PDX Finder
- Smart Cancer Navigator
- SoftGenetics - Geneticist Assistant NGS Interpretative Workbench
- SolveBio
- TCGA Next-Gen Clustered Heat Map Compendium
- The Hyve
- UCSC Genome Browser (My Data -> Track Hubs -> Cancer Genomics Tracks)
- Variant Interpretation for Cancer Consortium (VICC)
- VarSome
- Wikidata