【佳学基因检测】如何采用新的基因检测技术提高对多发性骨髓瘤复杂基因变化的基因检测和解析？

多发性骨髓瘤 (MM) 是一种血液恶性肿瘤，影响终末分化的 B 系细胞，其特征是骨髓中克隆性浆细胞的积累。它具有复杂的基因序列变化模式，被认为会导致该疾病在治疗反应和总体结果方面的多样性。新疗法的引入显着提高了生存率。然而，尽管取得了这些进步，但该疾病基本上仍然无法治愈，并且具有高风险畸变的患者继续表现出不良结果。因此，为了更好的制定治疗方案，需要通过更为精细的基因检测识别高危患者并了解潜在的疾病生物学。这是基因解码基因检测在精准医学时代所能发挥的独具特色的作用。

从《血液病患者的基因检测多样性》得知，根据发生在基因序列上的主要特征性变化，多发性骨髓瘤（MM） 主要分为超二倍体 (HRD) 和非 HRD 病例。在这个分类中，HRD多发性骨髓瘤的特征是奇数染色体的多重三体性，而非 HRD多发性骨髓瘤与免疫球蛋白重链 (IGH) 易位相关。最常见的 IGH 易位包括 t(4;14)、t(11;14)、t(6;14)、t(14;16) 和 t(14;20)，它们通过与强 Eμ 和3' 调节区 (RR) IGH 增强子分别引起多发性骨髓瘤SET/FGFR3、CCND1、CCND3、MAF 和 MAFB 的失调。传统上，这些原发性异常以及与不良结果相关的常见继发性事件（包括 17p 缺失、1q21 扩增和MYC易位），已在临床常规中使用荧光原位杂交（FISH）基因检测进行了研究。尽管启动事件看似简单的二分法，但下一代测序揭示了遗传畸变的复杂情况，导致一些基因检测方法只能识别某些特定的基因突变。这种基因序列变化的复杂情况通常包含一系列继发性遗传畸变，具有频繁的拷贝数变异 (CNV)、单核苷酸变异 (SNV) 和结构变异 (SV)，这些变异是由模板化插入、局灶性扩增、染色体复杂性、染色体碎裂或其他复杂的重排所引起。总的来说，这些畸变会影响浆细胞分化、细胞周期调节、DNA 修复和多种信号通路，从而使得每一种情况需要特定的靶向药物来治疗，这是多发性骨髓瘤高效治疗并改善结果对基因检测所提出的纯需求。血液科肿瘤基因解码正在努力鉴定各种可开发靶向药物的基因突变、畸变类型。正时由于药物研发与基于高通量测序的基因解码结俣在一起，创造了使用个性化医学策略治疗多发性骨髓瘤的可能性。

Linked-read 全基因组测序 (lrWGS) 是佳学基因检测、基因解码正在开发的一项新的基因测序技术，可以从传统的短读长测序中创建合成长读长。链接读取数据是通过生成源自单个高分子量 (HMW) DNA 分子的读取组或读取云来实现的，它们都带有将它们连接在一起的通用条形码。将读取云映射在一起并随后利用读取云中 SNV 的存在，可以改进大相块的映射和单倍型重建。lrWGS 数据进一步提供了通过分析跨越染色体断点的读取云来识别和重建 SV 的能力。一些研究已经有效地使用 lrWGS 来识别和描述各种癌症和其他疾病中通常很复杂的 SV。这使得 lrWGS 成为在多发性骨髓瘤和其他具有复杂基因组的疾病中提供全面基因信息的有吸引力的选择。

佳学基因检测可以直接在经过荧光激活细胞分选 (FACS) 的变性细胞上生成高质量的 lrWGS，而无需事先进行 DNA 纯化。在概念验证研究中将其应用于多发性骨髓瘤，血液病复杂基因变化的高精度基因检测发现 lrWGS 可靠地检测到 FISH 基因检测可以检出的易位和 CNV。此外，佳学基因新开发的全基因测序技术lrWGS 允许识别和解析各种基因信息的结构性变化，包括个体独特性结构变化，对患者个体的治疗和预后都有积极的影响。