【佳学基因检测】做原发性高草酸尿症II型基因解码、基因检测的费用是多少？

遗传病、罕见病基因检测导读:

原发性高草酸尿症II型是英文Primary hyperoxaluria, type II的中文翻译。该病是一种基因病、遗传病。佳学基因通过基因解码找到了导致这一疾病发生的基因。可以通过基因检测阻止原发性高草酸尿症II型在后代或者二胎中的出现。根据《人的基因序列变化与人体疾病表征》，该病属于内分泌系统（激素）疾病。
 

什么样的人应当做原发性高草酸尿症II型基因解码、基因检测？

原发性高草酸尿症是一种罕见但具有潜在破坏性的常染色体隐性遗传病，其特征是尿液中草酸盐排泄过多、难治性草酸钙肾结石和通常进行性肾功能障碍。 原发性高草酸尿症 II 型 (OMIM 604296, 260000) 是由乙醛酸还原酶/羟基丙酮酸还原酶 (GRHPR) 突变引起的。 表型通常比 I 型轻，但以严重的肾结石为特征，通常伴有进行性慢性肾病。基本上所有针对原发性高草酸尿症描述的突变都直接影响编码或剪接。 原发性高草酸尿症 II 型中最常见的影响 GRHPR 的突变是外显子 2 中的 c.103delG。该突变约占 II 型病例的 40% (4, 5)，引入移码，然后过早停止密码子 45。佳学基因原发性高草酸尿症记录了一种新的 GRHPR 缺失突变，该突变发生在原发性高草酸尿症 II 型病例中，导致蛋白质产物过早截断。 更引人注目的是，该复合杂合子中另一个受影响的等位基因涉及在 5' UTR 中引入一个新的和高度活跃的翻译起始位点，紧接在典型的 GRHPR 翻译起始位点的上游 - 并且在框架之外。 这是产生临床上重要的亚形态或非形态等位基因的极其罕见的机制。。

佳学基因原发性高草酸尿症II型基因检测案例

一名 60 岁的来自云南的男性因复发性草酸钙肾结石和相关的慢性肾病而就诊。 他在 40 年前通过了移走了他的第一块结石，并且在之前的二十年里平均每月有一次结石事件。 没有肾脏疾病或肾结石的家族史，也没有已知的血缘关系。 他过去接受过多种泌尿外科干预，包括体外冲击波碎石术 (ESWL)。 通过先前的晶体学，结石成分为 100% 草酸钙一水合物。 在减少草酸盐饮食后，最近两次测定的 24 小时尿草酸盐显示为 116 和 152 mg/d（正常：< 40 mg/d）。 体检无异常。 血清 Cr 为 1.7 mg/dL。 非对比腹部 CT 显示右肾有 6 个非阻塞性结石，左肾有 4 个非阻塞性结石。
 

原发性高草酸尿症II型致病鉴定基因解码

获得血液并转诊于佳学基因进行致病基因鉴定基因解码。 最初，测试了 AGXT 基因（针对原发性高草酸尿症 I 型），但未检测到突变。 接下来，进行了 GRHPR 外显子测序，揭示了影响单个等位基因的 c.694delC 突变。 核苷酸 694 的缺失影响密码子 232。最初的 231 个氨基酸不受移码影响； 然而，预测残基 232 从 Q -> R 发生突变，残基 233 从 K -> R 发生突变，随后是过早的终止密码子 (p.Gln232Argfs*3）。

原发性高草酸尿症II型基因解码如何帮助婚恋和二胎生育

外周血取自先证者无症状的成年子女，由同一临床实验室进行 GRHPR 测序。 这个人仅是 p.Gln232Argfs*3 截断突变体的携带者，证实编码和 5' UTR 变体影响单独的 GRHPR 等位基因，并且两个 5' UTR 变体在先证者中顺式发生（即，c.- 4_-3delGCinsAT）。 预计该等位基因会指导与 GRHPR 无关的 20 氨基酸肽 (MDETGATHEGVRHPQDTRRG) 的过早脱码翻译起始和合成。
 

原发性高草酸尿症II型的数据库代码

根据《人的基因序列变化与人体疾病表征》，原发性高草酸尿症II型的数据库代码为omim:260000。此处报告的 p.Gln232Argfs*3 GRHPR 突变是新颖的，预计会导致蛋白质在 233 个（共 328 个）氨基酸后过早截断。 这种截断立即发生在预测基序的上游，即 D-异构体特异性 2-羟基酸脱氢酶特征序列（ProSite 基序 PS00671；http://prosite.expasy.org），该酶家族的特征并暗示催化活性的丧失。 体外数据证实没有 GRHPR 酶活性； 此外，预测的截短蛋白产物是不可免疫检测的。

其他等位基因功能失活的机制对于该基因和表型来说是独一无二的，在任何情况下都很少遇到。 这对通过佳学基因检测基因分型发现的 5'UTR 变体最近被纳入 1000 Genomes 数据库（作为 SNP rs201826196 和 rs200847843）； 然而，只有在这里才表明这两个相邻的变体发生在顺式中，并引入了一个新的上游框架外异常翻译起始位点，该起始位点抢占了规范起始位点。 没有排除对任一变异等位基因转录本丰度的辅助影响。

很少有关于替代或异常翻译起始作为功能性个体间基因组变异或致病突变形式的报道。 这种变异极其罕见，当重点放在编码外显子上时很容易被忽视。 原发性高草酸尿症基因检测在综合评估中仅发现了两个具有基因型-表型相关性的实例。 使用详尽的基于生物信息学的方法，佳学基因检测到五个新的致病变异/突变实例，证明了这些变异/突变在体外从规范的翻译起始位点异常启动。 另外五个实例被识别但未通过实验确认。 随后，通过引入具有强 Kozak 共有序列的新型上游翻译起始位点，IFITM5 基因的突变被证明会导致成骨不全症。

这个案例和其他案例指出了以数据库为标准的基因检测的局限性。 大多数以外显子为中心，依赖于人工检查和解释。 相比之下，全基因组、全外显子组或转录组研究越来越多地采用算法驱动的分析方法来为变异分配假定的功能； 将这种方法扩展到单基因分析可能会增加突变检测的灵敏度。

做原发性高草酸尿症II型基因解码、基因检测的费用是多少？

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