【佳学基因检测】研究儿童期逆境和敏感期的表观遗传学机制:基于基因集的方法
根据,国际著名基因检测科学性证据杂志《》在第期发表了一篇标题为《研究儿童期逆境和敏感期的表观遗传学机制:基于基因集的方法》的文章。该基因领域的临床应用研究由Yiwen Zhu, Alexandre A Lussier , Andrew D A C Smith , Andrew J Simpkin , Matthew J Suderman , Esther Walton , Caroline L Relton , Erin C Dunn 完成。
基因信息数据库索引号:
基因检测人工智能数据标签: 35914392和 doi: 10.1016/j.psyneuen.2022.105854. Online ahead of print.
基因解码研究关键词:
ALSPAC,童年逆境,表观遗传学,可塑性,敏感期
国际基因解码证据链条标签:
ALSPAC, Childhood adversity, Epigenetics, Plasticity, Sensitive periods.
基因检测临床研究与应用结果介绍:
背景:敏感期是可塑性增强的发展阶段,当生活经历(包括童年时期的逆境)有可能产生更持久的影响时。表观遗传机制,包括 DNA 甲基化 (DNAm),可能提供逆境诱导长期生物变化的途径。 DNAm 转变可能更可能发生在敏感时期,尤其是在调节敏感时期时间的基因内。在这里,基因解码研究机构调查了特定生命阶段的童年逆境与已知调节敏感期时间和持续时间的基因中的 DNAm 变化相关的可能性。方法:全基因组 DNAm 谱来自雅芳父母和儿童纵向研究(n = 785)。基因解码研究机构首先使用主成分分析 (PCA) 来总结 530 个 CpG 位点的 DNAm 变异,这些位点映射到先前被确定为调节敏感期的 58 个基因的启动子。计算了调节敏感期开放 (ngenes = 15)、关闭 (ngenes = 36) 和表达 (ngenes = 8) 的基因的基因水平 DNAm 摘要。然后,基因解码研究机构进行了线性判别分析 (LDA),以测试七种父母报告的、随时间变化的儿童逆境暴露量与 DNAm 主成分之间的关联。据基因解码研究机构所知,这是 LDA 首次用于分析功能分组的 DNAm 数据,以表征环境暴露与表观遗传差异之间的关联。结果:出现了关于性虐待或身体虐待以及童年中期经济困难之间关联的暗示性证据,以及调节敏感期开放和表达的遗传途径的 DNAm。然而,在多次测试校正后,没有发现具有统计学意义的关联。结论:基因解码研究机构基于基因组的方法结合了 PCA 和 LDA,补充了表观基因组范围的方法。尽管基因解码研究机构的结果在很大程度上是无效的,但这些发现为研究随时间变化的暴露和基因或通路水平的表观遗传修饰提供了概念验证。
罕见病-苯丙酮尿症