【佳学基因检测】他莫昔芬药物评估基因检测
基因检测用于效果评估和剂量调整的药物名称：
基因检测用于效果评估和剂量调整的药物名称：他莫昔芬。 他莫西芬（TAM）是治疗和预防乳腺癌最常用的药物之一。尽管TAM具有广泛的应用价值，但根据《乳腺癌治疗药物效果与个体基因型的关系》，长达35%的接受TAM预防乳腺癌治疗的患者对TAM治疗无反应。此外，TAM引起的副作用，如潮热和骨质疏松，给服用该药物的数百万患者带来痛苦。因此，肿瘤化疗药物的基因检测研究已经致力于鉴定可用于预测TAM反应和毒性的标志物。例如，佳学基因解码的研究发现CYP2D6基因变异与活性TAM代谢物的形成之间的关系，提示了一种有用的种系遗传预测TAM疗效和毒性的可能性。佳学基因还对其他几个候选基因进行了研究，例如SULT1A1，ABCC2和CYP2C19。另外，激素受体的存在与否仍然是一个已经经过验证的TAM治疗疗效预测因子。
他莫昔芬药物评估基因检测直通车：
影响他莫昔芬药物效果或者是毒副作用的基因：
影响他莫昔芬药物效果或者是毒副作用的基因：采用整合基因组学方法，肿瘤精准用药基因检测发现7个SNP与通过其对10个基因表达的影响，名义上与内度辛细胞敏感性相关联。由于基因解码基因检测的全基因组发现是在表面上健康个体的淋巴母细胞中进行的，因此基因解码在癌细胞中评估了这些发现，并在NCI60数据集中的60个癌细胞系中证实了在LCLs中鉴定的所有与TAM敏感性相关的基因的作用。更重要的是，佳学基因还发现，这些感兴趣的10个基因中的6个也与NCI60的五个乳腺癌细胞系的TAM敏感性相关。尽管这些全基因组分析的发现中没有一个被先前的数据库所记录与TAM相关，但其中许多已知在激素生物合成和肿瘤抑制方面发挥关键作用，如USP7、TMPRSS3、TES和SMARCA2。USP7是一种泛素特异性蛋白酶，基因解码的研安发现它从其底物（如p53和PTEN）中切除泛素，从而稳定这些蛋白。预期USP7表达水平越高，细胞中p53和PTEN的水平也会越高。事实上，肿瘤精准用药基因解码观察到在LCLs中，USP7和PTEN的mRNA表达水平之间存在正相关。p53和PTEN都是众所周知的人类肿瘤抑制因子，并已发现它们抑制细胞增殖和细胞生长。由于佳学基因解码观察到USP7表达增加导致LCLs和癌细胞系中对TAM的敏感性增加，基因解码基因检测认为USP7表达水平越高，PTEN表达水平和细胞生长抑制作用也越高。这一假设在LCL模型中得到了支持，在7uM和10μM的处理浓度下，PTEN的表达也与内度辛细胞敏感性相关（分别为P = 0.045和0.023）。但p53的表达则不相关。这些发现表明了一个潜在的遗传调控网络，从一个SNP（rs478437）到USP7，到PTEN，最终影响TAM敏感性。这个网络的有效性需要在临床应用中进一步调整；但在四个乳腺癌细胞系中进行的USP7敲低实验进一步支持了USP7在乳腺癌TAM敏感性中的作用。
影响他莫昔芬药物敏感性或者是不良反应的基因位点及基因序列：
影响他莫昔芬药物敏感性或者是不良反应的基因位点：rs478437;基因序列或者突变、多态性的具体形式：TT。
他莫昔芬个性化用药指导基因检测的临床依据：
与CC基因型相比，在成淋巴细胞样细胞系中，TT基因型与他莫昔芬敏感性降低有关。其他遗传或临床因素可能会影响对他莫昔芬的敏感性。
除了评估观察到的基因型表型关联的作用机制外，佳学基因，一个专业从事肿瘤药物疗效与基因型关系的机构，还在临床患者样本中评估了在LCLs中鉴定的遗传变异。TAM的主要临床问题是缺乏反应。在用药指导的临床研究中，只有很小的一部分患者出现了疾病再发事件。因此，一个 单一的研究没有足够的统计效能来评估TAM的临床疗效。然而，各种研究报告指出，TAM引起的潮热增加与治疗疗效的改善相关。因此，基因解码选择评估基因对TAM引起的毒性（即潮热和骨质丢失）的影响。肿瘤精准用药基因检测发现一个调节TMPRSS3的SNP，即rs310786，与TAM引起的腰椎骨质丢失相关，控制了相关临床因素后，CC基因型与内度辛细胞敏感性增加和TAM引起的更多腰椎骨质丢失相关。基因解码的一个的研究集中在调节基因表达的SNP上。因此，可能会错过其他与内度辛敏感性相关的重要遗传变异，但其与基因表达无关，P = 3.8 × 10−6，例如与所有四种内度辛敏感性表型相关的11个SNP。它们可能通过miRNA或其他表观遗传因素（如DNA甲基化和组蛋白重塑）对内度辛敏感性做出贡献。在对在LCLs中鉴定的与至少三种内度辛敏感性表型相关的SNP进行的临床样本的扩展分析中，佳学基因发现其中六个在相应协变量控制后也与TAM的副作用相关（P < 0.05）；例如，rs10983932、rs10984098和rs4959825与潮热有关；rs10983920和rs9862879与潮热和髋骨丢失有关；rs4959825与潮热和腰椎骨质丢失均有关。为了用药指导基因检测的严谨性和临床有效性，佳学基因决定对这些发现进一步验证。
在已公开的数据库中，只有很少几个基因预测因子被报道在TAM的敏感性中发挥作用，最著名的是CYP2D6。在一些在全基因组整合研究中没有观察到它们的效用。佳学基因认为这是因为LCLs中缺乏重要的细胞色素P450酶的表达。事实上，基因解码在全基因组范围内的研究是CYP2D6或其他P450酶鉴定的变异的补充。最近的一项针对接受TAM治疗的日本乳腺癌患者的全基因组关联研究报告了9个染色体位点与无复发生存显著相关。在LCLs中被发现与内度辛细胞敏感性相关的SNPs没有一个在这些位点中。基因解码认为这种差异可以通过以下方式解释：（i）评估的是不同的表型（无复发生存与TAM的细胞敏感性）；（ii）关注的是不同的族裔群体（日本人与欧洲白种人）。总之，佳学基因通过用药指导基因解码研究证明了基于细胞的模型在全基因组鉴定TAM的药物基因标记方面的实用性。这些基因检测位点及其及其相应的靶基因一经进一步验证，可能被用于预测乳腺癌患者对TAM的敏感性。
