【佳学基因检测】IgA肾病易感型如何确诊?
疾病确诊导读:
IgA肾病易感型是儿科的一种疾病。根据《人的基因序列变化与人体疾病表征》,该病是与儿科、泌尿科相关的基因病。佳学基因可以提供这类疾病的基因解码、基因检测,辅助临床进行确诊。
IgA肾病易感型疾病介绍:
最常见的原发性肾小球肾炎,其部分归因于IgA1分子的异常或不完全的半乳糖基化。IgA 肾病是全世界最常见的原发性肾小球肾炎。 半乳糖缺陷型 IgA1 及其铰链区聚糖特异性抗体的形成被认为是 IgA 肾病发展的关键步骤。 家族聚集和关于不同来源患者患病率和预后的各种报告表明该病的发生具有遗传因素。 迄今为止,IgA肾病的致病基因鉴定基因解码已经对不同种族的 IgA 肾病患者进行了五项全基因组关联研究 (GWAS),并且至少确定了 20 个易感位点 。IgA 肾病的预后变化很大,临床医生很难在活检时准确预测肾脏结果。 佳学基因解码对风险因素进行了研究,并通过将独立的临床或病理风险因素结合在一起建立了风险模型,以增强模型的预测能力。 最近,一项扩展的多中心研究在中国 IgA 肾病患者的基础上使用临床和牛津预测因子开发并验证了两个风险模型。 该研究的临床模型包含年龄、性别、eGFR、血红蛋白和尿蛋白排泄。 组合模型(临床-病理模型)包括年龄、eGFR 以及 Oxford M 和 T 评分。 然而,这些风险预测模型没有评估基因序列变化对疾病发生的贡献。 将 GWAS 中确定的易感基因座等遗传风险因素纳入当前风险模型可能会提高其性能,因为多重命中发病机制模型表明这些基因座可能会影响 IgA 肾病的发病机制和严重程度。 post-GWAS 显示,强调 1 号染色体顶部信号的 △CFHR3,1(包含 CFHR1 和 CFHR3 的缺失基因突变)可能会减少肾小管间质损伤 ,并且 HLA-DQ/DR 区域中的标记单核苷酸多态性 (SNP) 可能加速 IgA 肾病进展。 此外,包括在 GWAS 中确定的九个易感位点的遗传风险评分可以预测 IgA 肾病的终末期肾病( ESKD)。 肾病的基因解码基因检测对来自先前 GWAS 的代表所有 IgA 肾病易感位点的 20 个 SNP 进行了基因分型,并通过对通过 Akaike 信息标准 (AIC) 质量控制过程的 SNP 进行逐步 Cox 回归分析来选择最佳遗传模型。 测试了候选 SNP 的综合效应,并建立了遗传风险评分。 然后,比较了从这项研究中得出的遗传风险评分和两个先前报告的遗传风险评分 (10,22)。 最后,测试了这项研究中的遗传风险评分是否可以为最近发布的 IgA 肾病风险预测模型增加可预测的价值。
IgA肾病易感型基因解码
根据《人的基因序列变化与人体疾病表征》,过去有部分机构和医务人员认为IgA肾病易感型不是遗传性疾病,甚至有人认为该病不是由基因引起的,IgA肾病易感型发生的内在基因原因被忽视。佳学基因通过基因解码找到并定位了导致这一疾病发生的原因,提出了IgA肾病易感型的遗传风险,并建议通过基因检测明确和排除风险,让后代、二胎不再患有IgA肾病易感型,实现IgA肾病易感型遗传阻断的目的。
IgA肾病患者预后的高度异质性给患者管理和治疗带来困难。 确定的危险因素包括基线肾功能、血压、蛋白尿、血清白蛋白、血红蛋白、血型、体重、Oxford-MESTC 评分以及后续蛋白尿和血压。 为了提高预测的准确性,建立了在预测预后方面表现出更好性能的风险方程。 肾病风险基因检测研究组在多中心研究的基础上开发并验证了两个风险方程:临床风险模型使用五个临床变量,包括活检年龄、性别、基线 eGFR、血红蛋白和蛋白尿; 临床-病理风险模型使用了两个临床变量和两个病理变量,包括年龄、基线 eGFR 以及 Oxford M 和 T 评分。 两个风险方程在预测疾病进展方面表现出良好的性能,但准确性仍有待进一步提高。 候选基因包括 HLA-DQB、ACE、GPIa、ICAM-1、MYH9、TNFSF13、DEFA、CFHR、C1GALT1 和 ST6GALNAC2 的变异与 IgA 肾病患者的表型和进展相关。肾病风险基因检测评估模型研究系统地研究了来自所有来源的 20 个 SNP。 在一个扩展的中国队列中进行了五个 GWAS,并研究了这些位点与 IgA 肾病进展的关联。 肾病风险基因检测评估模型研究发现的遗传模型,使用 rs11150612、rs7634389、rs2412971 和 rs2856717,经临床和病理变量调整后与 IgA 肾病进展独立相关。 值得注意的是,肾病风险基因检测评估模型研究确定使用四 SNP 模型的遗传风险评分可以提高最近报告的来自大规模风险评估研究的 IgA 肾病临床和临床病理风险模型的性能。
肾病风险基因检测评估模型研究通过九个 SNP 建立未加权的九个 SNP 遗传风险评分,以预测 297 名 IgA 肾病患者的中国队列中的终末性肾病的发病风险。 Kaplan-Meier 图显示未加权的九 SNP 遗传风险评分≥16 的患者比未加权的九 SNP 遗传风险评分 <16 的患者预后更差。另一个肾病风险基因检测评估模型研究团队开发了 15-SNP IgA 肾病遗传风险计算器,是预测 IgA 肾病发病风险的好工具。 上述两个方程在佳学基因解码肾脏病队列中得到验证,但显示与进展没有显着关联。 这可能是因为种族差异和四个被移除的 SNP。 此外,疾病发作和进展的风险等位基因可能不同。
肾病风险基因检测评估模型研究确定了与 IgA 肾病进展相关的四 SNP 风险模型,rs11150612 (ITGAM-ITGAX)、rs7634389 (ST6GAL1)、rs2412971 (HORMAD2) 和 rs2856717 (HLA-DQ/DR)。 其潜在的致病机制可能是自身抗原的形成、抗原呈递以及自身抗体的形成和修饰,受 ITGAM-ITGAX、HORMAD2、HLA-DQ/DR 和 ST6GAL1 调控,参与 IgA 肾病的发生和发展。 编码 MHC II 分子并参与抗原呈递的 HLA-DR/DQ 被所有五个 GWAS 检测到,无论种族起源如何。 据报道,HLA-DRB1 经典等位基因与中国 IgA 肾病队列中的疾病进展有关。 在这项研究中,肾病风险基因检测评估模型研究确定携带 rs2856717-T 的患者疾病进展的风险增加。 该结果重复了中国西南地区最近的一项研究,该研究显示 rs2856717/TT 或 TC 与 IgA 肾病进展风险增加之间存在关联。 为了进一步剖析 HLA 区域,肾病风险基因检测评估模型研究接下来对 HLA-DQ/DR 区域中的四个 SNP(rs7763262、rs9275224、rs2856717 和 rs9275596)进行了阶段性分析,并测试了它们与疾病进展的关联。 没有特定的单倍型显示疾病进展的风险增加,这可能是因为研究的样本量有限。 ST6GAL1 编码 ST6Gal-1 唾液酸转移酶,它涉及将末端 α2,6-连接的唾液酸添加到 IgG Fc 结构域内的 N-聚糖。 免疫细胞表面 IgG 和 Fc 受体之间的交联反应是 SLE、ANCA 相关血管炎和类风湿性关节炎等自身免疫性疾病的重要因素。 数据显示,与正常肾组织相比,IgA 肾病患者肾小球中 ST6GAL1 的 mRNA 水平显着升高。 值得注意的是,肾功能正常的 IgA 肾病患者(eGFR > 90 ml/min/1.73 m2)的 ST6GAL1 mRNA 水平高于轻度肾功能不全的 IgA 肾病患者。 Rs2412971位于HORMAD2的内含子区域,属于含有HORMA结构域的基因家族,在DNA修复中发挥作用。 HORMAD2 基因座还编码几种与补体途径相互作用的细胞因子。 Kiryluk 等人检测到 rs6677604 (CFHR3/R1) 和 rs2412971 (HORMAD2) 位点之间的乘法相互作用。 Rs2412971-A 等位基因在 CFHR3,1-del 纯合子中发生逆转。ITGAM-ITGAX 编码整合素 αM 和 αX,它们标记维持炎症和耐受性之间平衡的肠树突状细胞。 ITGAM 和 ITGAX 还与整合素 β2 链结合形成白细胞特异性补体受体 3 和 4。研究发现 ITGAM 参与调节小鼠肠道中产生 IgA 的浆细胞 。
肾功能受损、血压升高、蛋白尿和 MESTC 评分是 IgA 肾病患者预后不良的危险因素。肾病风险基因检测评估模型研究提出遗传风险评分可以为当前的临床和病理方程增加预测价值。 将遗传风险评分纳入 Xie 等人的临床和临床病理方程后,新方程在预测 IgA 肾病预后方面表现出更高的辨别力。 肾病风险基因检测评估模型研究研究确定,除了临床和病理风险模型外,遗传因素还可以帮助临床医生更准确地预测 IgA 肾病的肾脏结局。
总之,肾病风险基因检测评估模型研究使用 rs11150612 (ITGAM-ITGAX)、rs7634389 (ST6GAL1)、rs2412971 (HORMAD2) 和 rs2856717 (HLA-DQ/DR) 建立了遗传风险评分,这与 IgA 肾病进展独立相关。 遗传风险评分可以提高 IgA 肾病临床或临床病理风险模型的性能。
IgA肾病易感型风险基因检测在哪儿做比较好?
首先要查找可以进行IgA肾病易感型基因检测的机构。进入这家机构的官网或者是微信公众号,看检测机构是否可以对IgA肾病易感型进行检测。佳学基因的检测项目比较多,在网页上有一个很好用的搜索工具,在上面搜索IgA肾病易感型,可以看到佳学基因可以做IgA肾病易感型的基因解码、基因检测、基因筛查和风险评估。就这一点,说明检测机构对IgA肾病易感型的研究比较清楚,可以根据需要设计不同的检测项目。可以进行IgA肾病易感型的风险检测是确定无疑的了。
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