【佳学基因检测】肿瘤精准用药850基因检测如何确定肿瘤治疗的新抗原

肿瘤新抗原如何指导精准医学？

癌症免疫疗法的疗效依赖于淋巴细胞对肿瘤抗原的正确识别，从而引发能够消除肿瘤细胞的功能反应。因此，在抗原鉴定方面进行了重要的努力，目的是了解免疫疗法的反应机制，并设计更安全、更有效的策略。除了在过去几十年中鉴定出的经典肿瘤相关抗原外，下一代测序方法的实施使得能够鉴定由突变引起的新抗原（neoAgs），从而开发出新的neoAg导向疗法。此外，还有许多来自其他来源并通过新方法鉴定的非经典肿瘤抗原。在此，佳学基因肿瘤精准医学基因解码综述了新抗原在不同免疫疗法中的相关性，以及应用基于新抗原的策略所获得的结果。此外，还介绍了不同类型的非经典肿瘤抗原及其鉴定的最佳方法。这将有助于增加癌症免疫疗法中有用的靶向分子的光谱。

肿瘤精准用药850基因检测如何确定肿瘤治疗的新抗原关键词

肿瘤新抗原；免疫肽组学；突变；非经典肿瘤抗原；

基因检测如何确定肿瘤治疗的新抗原

基因检测确定肿瘤治疗的新抗原的过程可以大致分为以下步骤：

1. 提取肿瘤组织及瘤旁组织的DNA或RNA，并进行测序。这一步可以通过全基因组测序（WGS）、全外显子测序（WES）或RNA测序（RNA-seq）等技术来完成。
2. 对测序结果进行数据过滤，然后通过基因变异检测软件分析基因变异，通过融合基因检测软件分析融合基因。在这个过程中，需要关注单核苷酸变异（SNV）、插入或删除（INDEL）等突变类型，因为其中一些突变可能含有肿瘤发展、进展、转移与预后的重要信息。
3. 预测突变的蛋白。将突变的蛋白质水解加工成短肽（通常为8~10氨基酸长的肽段），这些肽段有可能成为新抗原。
4. 评估这些突变肽与主要组织相容性复合物（MHC）的结合亲和力。这一步可以通过计算样本的突变移码、剪接变体、基因融合、基因表达等变异，预测所编码的突变肽与样本的MHC的结合亲和力。
5. 结合现代蛋白质组学和生物信息学技术，筛选出可能被T细胞识别并具有较强免疫原性的肿瘤新抗原多肽基因序列。

通过以上步骤，可以确定与肿瘤治疗相关的新抗原，为肿瘤免疫治疗提供重要依据。这个过程涉及到多个领域的交叉，包括基因组学、蛋白质组学、免疫学等，需要高度专业化的技术和设备支持。