【佳学基因检测】腹主动脉瘤基因检测中的一个miRNA位点
腹主动脉瘤(AAA)是指腹主动脉局部异常扩张,多发生于老年男性。 MicroRNA (miRNA) 是由 18-25 个核苷酸组成的单链 RNA。它在转录后基因表达以及人类功能和疾病发展的调节中起关键作用。 miRNA 主要通过互补碱基对与 mRNA 转录本的 3' 调节区的结合来发挥其功能。因此,miRNA 相关的单核苷酸多态性(miRSNPs)可以影响 miRNA 的表达和加工动力学。 miRNSNP可以根据它们的位置进行分类:miRNA产生基因内的miRSNP和miRNA靶基因内的miRSNP。越来越多的证据表明,miRSNPs 在心血管疾病的致病动力学中发挥着重要作用。佳学基因检测旨在识别潜在的miRNAs并将其整合到基于miRSNP的疾病相关通路网络中,其结果对于解释miRSNPs在疾病发病机制中的潜在机制和功能并在基因检测后给出个性化的建议具有重要意义。
佳学基因检测发现 METTL14 和 HNRNPC 是下调的 m6A 调节因子,而 RBM15B 是人类腹主动脉瘤中上调的甲基化转移酶。 修饰的基因主要富集于 RNA 分解代谢过程、翻译调节、粘着斑、转录辅助调节剂活性、核糖体、RNA 转运、细胞周期等。 METTL14、HNRNPC和RBM15B水平与Tcm、巨噬细胞、肥大细胞、Tgd和NK CD56bright细胞的免疫浸润程度相关。 三个调节因子共有154个和76个靶基因分别参与AAA疾病的机体代谢和自噬,并确定了它们的相互作用关系和枢纽基因。 还为 METTL14、HNRNPC 和 RBM15B 构建了 lncRNA-miRNA-mRNA 相互作用调控网络。 根据基因解码基因检的临床组织和血清样本,METTL14 在 AAA 及其破裂类型中表现出较低的表达水平,METTL14 的低表达与高水平的 WBC 和 CRP 相关(均 P < 0.05)。
腹主动脉瘤发生的miRNA基因检测位点在 GSE144431 中鉴定出 40 个差异表达的 circRNAs (DECs),在 GSE62179 中鉴定出 90 个差异表达的 miRNAs (DEmiRs),在 GSE7084 中鉴定出 168 个具有相同方向调控的差异表达 mRNAs (DEGs)(130 个下调和 38 个上调), GSE57691 和 GSE47472 数据集确定了有关 腹主动脉瘤(AAA)的信息。然后预测了三个 DEC 的 miRNA 响应元件 (MRE)。通过将预测的 miRNA 和 DEmiR 相交,获得了四个重叠的 miRNA。然后,将4个miRNA的预测靶mRNA与168°相交,得到17个重叠的mRNA。此外,通过3个circRNA、4个miRNA和17个mRNA构建了circRNA-miRNA-mRNA网络,并鉴定了3个中枢基因(SOD2、CCR7和PGRMC1)。同时,对circRNA-miRNA-mRNA网络中的基因进行功能富集和通路分析。根据功能富集、蛋白质-蛋白质相互作用和 ceRNA 网络分析,其中三个(SOD2、CCR7 和 PGRMC1)被认为是至关重要的。此外,SOD2和CCR7的表达可能受hsa_circ_0011449/hsa_circ_0081968/hsa-let-7f-5p的调控; PGRMC1 的表达可能受 hsa_circ_0011449/hsa_circ_0081968-hsa-let-7f-5p/hsa-let-7e-5p 调控。
总之,腹主动脉瘤(AAA)发生发展的基因解码确定的 ceRNA 相互作用轴可能是治疗腹主动脉瘤的重要靶点。腹主动脉瘤(AAA)基因检测与基因解友g研究从腹主动脉瘤(AAA)中与 circRNA 相关的竞争性内源性 RNA 网络的角度进一步了解了潜在的发病机制。
(责任编辑:佳学基因)