【佳学基因检测】如何基因检测自噬过程的物质是否有基因突变？

佳学基因解码自噬现象

自噬人体日常活动中时刻发生的一下正常现象。其异常发生是人体多种疾病的基础。目前，还没有基因检测可以准确检测自噬过程的基因突变。因为没有这样的数据库建立。但是采用基因解码是可以鉴定患者中的基因突变是否会影响人体的生理过程。

根据《人体生理过程的基因解码》，自噬是指将细胞质或细胞外成分输送到动物细胞的溶酶体或植物或酵母细胞的液泡中的过程。自噬过程中产生的一个细胞器在《人体的基因序列变化与人体疾病表征》中被叫做自噬体。自噬体的产生和成熟直接受位置、时间和强度的调节。磷脂酰肌醇结合蛋白HS1BP3是自噬体生物发生的负调节因子，调节自噬体前体膜的脂质成分和磷脂酸（PA）水平。据基因解码结果，秀丽隐杆线虫体内的系统性自噬水平增加，激素性热应激和热休克反应转录因子（HSF-1）诱导自噬以改善蠕虫的存活和蛋白质稳定。此外，基因解码还发现，自噬通过组蛋白（辅激活子相关）精氨酸甲基转移酶CARM1的表观遗传调节进行微调，CARM1是继组蛋白H3R17二甲基化（组蛋白H3在精氨酸17处甲基化）之后的一种新酶，是饥饿诱导自噬的一个重要表观遗传标记。此外，维生素D受体可调节正常乳腺和腔型乳腺癌细胞的自噬，表明维生素D水平与乳腺癌风险之间存在潜在的治疗联系。肿瘤850精准用药基因解码中，包含了与自噬过程及维生素D的吸收和应用有关的基因。还有许多其他调节自噬的内源性和外源性因素，如转录因子、各种细胞质生化物质数量或浓度的变化、受损的细胞器、外源化合物和病原体；因此，自噬机制各不相同，不同的基因发生突变也会对自噬过程有不同的影响。根据细胞内物质进入溶酶体降解的机制以及靶向溶酶体底物的分子结构，自噬可分为巨噬细胞自噬、微自噬和CMA。尽管这些途径在机制上不同，但它们都通过溶酶体进行降解。大多数形式的选择性自噬涉及特定靶点的降解；例如，有丝分裂吞噬（线粒体）、嗜中性粒细胞吞噬（过氧化物酶体）、嗜酸性粒细胞吞噬（蛋白质聚集体）、嗜糖（糖原）、嗜脂（脂质）、嗜核糖体（核糖体）、嗜异种（病原体）和嗜内质网。自噬是真核生物起始因子2（eIF2α）激酶途径的一种新的、进化上保守的功能，它由一个进化上保守的丝氨酸/苏氨酸激酶家族组成，调节应激诱导的翻译阻滞，并成为毒力基因产物的作用靶点。
 

巨自噬

当含有细胞器的细胞质的一部分被隔离形成自噬体时，巨自噬过程开始。自噬体与溶酶体或晚期内体多泡体（MVB）融合，降解其中的物质。Atg8（微管相关蛋白1A/1B轻链3，LC3，是人类的Atg8同系物）是第一个经过基因解码过程被鉴定的自噬体蛋白。宏自噬可分为货物特异性或非选择性两种形式。

当不可发酵碳源和可发酵碳源（如葡萄糖）发生变化时，酵母中观察到有丝分裂吞噬作用，随后多余的线粒体群体经历有丝分裂吞噬。第一个在酵母中引起线粒体吞噬的蛋白质是SUN家族的成员Uth1p，它存在于线粒体外膜中，并允许在饥饿期间去除过多的线粒体[125]。线粒体外膜蛋白Atg32是选择性自噬的受体，在哺乳动物物种中并不保守；相反，FUNDC1和BNIP3、BNIP3L/NIX和SQSTM1/p62作为线粒自噬的吞噬受体，分别依赖于缺氧、红细胞成熟和损伤诱导的线粒体吞噬。当真菌培养基从油酸或甲醇转换为葡萄糖或氮饥饿培养基时，酿酒酵母和毕赤酵母也分别通过Atg36和PpAtg30受体诱导自噬过程。饥饿也被证明会诱导非选择性巨自噬，而线粒体磷脂已被证明是自噬所必需的。利用酵母细胞对选择性自噬所需的机制进行了广泛的研究，发现细胞质-液泡靶向（CVT）途径用于将液泡水解酶特异性地运输到芽殖酵母细胞的液泡中。在哺乳动物自噬过程中，起始膜（吞噬细胞或隔离膜）的高度弯曲是CVT囊泡的一个显著特征。