【佳学基因检测】TP53/P53在肿瘤发生、诊断与靶向药物治疗中的作用
肿瘤基因检测为什么需要解码TP53/P53
p53是一个主要的调节蛋白,参与了各种细胞代谢过程,如凋亡、DNA修复和细胞周期阻滞。p53在人体细胞内以四聚体形式的存在,如果没有突变,它是人体天然的肿瘤抑制剂,从而免于人体罹患肿瘤。但是由于各种突变的存在,50%的肿瘤患者丧失了以上功能。佳学基因解码发现在人体中多种p53状态,肿瘤基因解码的功能之一是将将p53的状态与肿瘤对治疗的反应及临床结果关联起来,因此对p53的调控途径的解码虽然复杂但必不可少。
除突变位点和区域外,肿瘤基因解码还发,p53同型异构体的表达模式可能在规范和癌细胞对各种压力做出反应中起关键作用。人类TP53基因至少编码12种p53同型异构,它们通过替代性起始翻译、使用替代性启动子和替代性剪切在正常组织中产生。基因解码认为变异p53聚合体的形成可能与癌症发生相关,因为它导致了失活(LoF)、优势负(DN)和获得功能(GoF)的效应。由于不同的同型体或p53的聚合状态可能影响肿瘤发生,本综述旨在检查p53同型体和聚合与癌症的相关性。
肿瘤发生中需要对TP53基因所作的解读:
截至到2023年10月17日。数据库记录中的移码突变为351个。存在明确解读依据的只有295个,而没有明确解读和注释的高达64个。至少由基因解码列出的超过2200个移码突变未在数据库中列出,单是对这一种突变类型的解读和分析,基因解码技术是数据库比对技术的7倍以上。
基因解码对肿瘤基因TP53的更深层次的解码
除了包括基因位点突变,多态性分析,拷贝数分析及基因相互作用分析以外,基因解码还关注了P53蛋白的同形异构体。根据肿瘤患者的基因分析,如果只关注基因序列的突变,只在25%的癌性肿瘤中检测到TP53_基因的突变,这说明还有其他可影响p53活性的因素参与了肿瘤的发生与转移恶化。p53同型体的过度表达或失调可解释癌症的发生,因为它们可以抑制典型p53的功能。如果p53失活,本应死亡的DNA损伤细胞可以存活下来并引起癌症。临床研究发现在不同癌症中p53同型体存在异常表达。p53同型体可看作细胞内的微处理器,因为它们微调人体生殖细胞和体细胞中的p53途径,使人体能够维持基因组稳定性,直到成熟甚至更长时间。除了Δ133p53β同型体(截至2010年未在正常组织中发现)外,所有p53同型体均可在癌症和正常组织中检测到。突变和同型体互相作用并改变癌症的结果。Δ133p53或p53γ分别克服卵巢癌或乳腺癌中突变p53的不良影响。对基因检测的分析,除了基因突变序列外,对同型体的分析,从另一个方面增加肿瘤基因检测及靶向药物寻找的准确性。
(责任编辑:佳学基因)