【佳学基因检测】肿瘤的分子诊断指南
肿瘤的分子诊断指南基因检测：
指导最优治疗选择的必要条件是确定肺癌中可靶向的基因改变。鉴于肺癌分子和生物标志物测试的环境持续变化，肿瘤医生和患者需明确应对哪些样本进行测试，测试应如何进行，以及应对哪些目标进行测试，以便提供治疗患者所需的临床相关的基因信息。当前，有多个针对此主题的指导原则，以协助病理学家和实验室工作人员最有效地利用来自肺癌患者的小型样本进行辅助分子检测。
本文关键词
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在过去的十年时间里，肿瘤科已经开始依赖于组织和/或血液的生物标志物来指导对晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者的治疗决策。目前，已经根据基因检测结果识别出多个根据生物标志物定义的患者子群，研究证据明确表明，与传统的细胞毒性化疗相比，靶向治疗能够带来更佳的临床效果。然而，精准肿瘤领域的飞速发展也带来了一个挑战，即如何将这些推荐准则转化为临床实践。在这篇综述中，肿瘤基因解码探讨了推荐在NSCLC中进行生物标志物检测的主要指南，同时也阐述了在美国以及全球范围内如何将这些指南应用于NSCLC患者的实际挑战。肿瘤基因检测还将讨论常用于组织和血液生物标志物检测的技术。最后，肿瘤靶向药物基因检测将探讨解释生物标志物测试结果以及如何利用这些结果来指导治疗决策的挑战。
怎样才能诊断准确？
随着肺癌治疗日益依赖于生物标志物，并且有效的靶向治疗迅速涌现，各大组织尝试定义最佳实践，决定哪些测试是必要的以及针对哪个目标人群。然而，这种实践在跟上快速变化的领域方面面临着一系列挑战。尽管EGFR基因中的敏感性突变最早在2004年被描述，后续的多次试验表明，EGFR酪氨酸激酶抑制剂（TKI）在这个亚组患者中优于化疗，但直到2011年，ASCO才发布了第一份临时推荐，支持对所有肺腺癌患者进行常规的EGFR突变检测。在同一年，crizotinib被批准用于治疗间变性淋巴瘤激酶（ALK）重排的NSCLC，这说明了靶向疗法的快速采纳以及指南跟上的挑战。
2013年，美国病理学家学会（CAP），国际肺癌研究协会（IASLC）和分子病理学协会（AMP）联合发布了指南，建议对肺癌患者进行EGFR突变和ALK基因融合的常规检测。除了生物标志物本身，这些指南还详细推荐了目标人群（所有晚期肺腺癌患者，无论临床指标如吸烟状态、种族或性别）、推荐的测试方法，以及建议的完成时间不超过14天。这个指南确定了当前仍适用的NSCLC的分子测试的护理标准，尽管现在目标已经扩大。
2018年，CAP/IASLC/AMP指南进行了更新，增加了建议对ROS1基因重排进行常规测试，因为在这个人群中，TKI如crizotinib的效果显著。然而，指南委员会在2017年6月批准dabrafenib和trametinib治疗BRAF+ NSCLC之前刚刚完成了其正式审查，因此，这个人群未被包括在推荐中。指南还建议所有第一代或第二代EGFR TKIs进展的EGFR突变患者进行T790M突变的常规检测，并增加了在组织无法获取时使用无细胞DNA进行检测的认可。不久后，ASCO对CAP/IASLC/AMP的指南进行了认可，但进一步扩大了建议，包括常规BRAF突变检测。另一个常被查询的推荐来源是全国综合癌症网络的指南，它目前与ASCO的推荐相符。
美国和国际组织的指南之间也有一般的一致性。2018年的欧洲医学肿瘤学会（ESMO）临床实践指南也建议常规检测EGFR、ALK和ROS1，并评论说BRAF靶向药物在一些欧洲国家获得批准。2018年，ESMO和中国临床肿瘤学会发布了共同的泛亚洲指南，推荐所有晚期非鳞状NSCLC进行EGFR突变、ALK重排、ROS1重排和BRAF突变，以及PD-L1免疫组织化学的常规检测。增加PD-L1免疫组织化学（IHC）染色是基于免疫检查点抑制剂pembrolizumab在二线治疗中对PD-L1 1%或以上的肿瘤，以及在一线治疗中对PD-L1表达50%或以上的患者的改善结果。中国、日本、韩国、马来西亚、新加坡和台湾的主要肿瘤学会都支持这些指南。
在NSCLC中，还有一些新兴的分子靶点和治疗方法，其中一些可能接近临床实践（并已经有助于临床试验的选择），如RET重排，MET外显子14跳跃突变和HER2激活突变。其他癌症中出现的分子改变也可以在NSCLC的一小部分中出现，例如可以用NTRK TKIs治疗的NTRK基因重排。此外，可能有必要测试KRAS突变，这是肺腺癌中最常见的癌基因突变，通常与其他可靶向改变互斥，因此可能有助于决定哪些患者需要或不需要进行更广泛的检测。
总的来说，所有的晚期非鳞状NSCLC患者，无论年龄、种族或吸烟状况如何，以及一些鳞状细胞癌患者，如非吸烟者或40岁以下的人，都应至少接受EGFR突变，ALK和ROS1重排，BRAF突变，以及PD-L1 IHC的测试（表1）。如果使用下一代测序（NGS）进行更广泛的测试，还应评估诸如RET，MET，HER2和KRAS等基因的额外改变。
表型描述
实用应用： 对新诊断为非小细胞肺癌（NSCLC）的患者进行生物标志物测试是确定最佳治疗方案的必要步骤。 CAP/IASLC/AMP、ASCO 和全国综合癌症网络（NCCN）等实用指南有助于确定使用哪些最合适的生物标志物和检测方法。 基于血浆的检测与基于组织的检测相比有很多优点，如非侵入性、快速且容易在一段时间内重复，但它们可能不如基于组织的检测灵敏，因此不能作为NSCLC患者的单独检测。 有许多不同类型的基于组织和血液的检测可用于生物标志物测试，每种都有其自身的优点和缺点，医生在决定使用哪种检测时应当了解。 下一代测序（NGS）报告包含大量信息，必须在用于制定治疗建议之前仔细解读;
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