【佳学基因检测】在溶组织内阿米巴中建立基于定量 RNAi 的正向遗传学和生长所需基因的鉴定

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在高峰论坛中博士医师年度双基练习体会到《Int J Nanomedicine》在 2021; 16: 3217–3240发表了一篇题目为《在溶组织内阿米巴中建立基于定量 RNAi 的正向遗传学和生长所需基因的鉴定》肿瘤靶向药物治疗基因检测临床研究文章。该研究由Liyu Zhang, Meng Wang, Zeen Zhu, Chenxi Ding, Shengquan Chen, Haibin Wu, Ying Yang, Fengyu Che, Qiao Li, and Hui Li,等完成。促进了肿瘤的精准治疗与个性化用药的发展，进一步强调了基因信息检测与分析的重要性。

肿瘤靶向药物及精准治疗临床研究内容关键词：

溶组织内阿米巴,正向遗传学,深度测序分析

肿瘤靶向治疗基因检测临床应用结果

虽然溶组织内阿米巴仍然是一种全球重要的病原体，但它的研究却大大不足。 E. histolytica 的易处理性历来是有限的，这主要是由于其基因组的挑战性特征。为了实现正向遗传学，我们构建并验证了第一个全基因组溶组织大肠杆菌 RNAi 敲低突变体库。该文库允许 Illumina 深度测序分析，以定量鉴定选择后富集或耗尽的突变体。我们开发了一种新的分析流程来精确定义和量化基因片段。我们使用该库在 E. histolytica 中进行了第一次 RNAi 筛选，并确定了缓慢生长 (SG) 突变体。在 SG 突变体中靶向的基因中，许多具有与细胞生长或代谢途径中的作用一致的注释功能。一些靶向基因被注释为假设的或缺少注释的域，支持正向遗传学在发现无法从数据库中收集的功能信息方面的力量。虽然通过序列分析无法预测 SG1 和 SG2 突变体中靶向的蛋白质的定位，但我们通过实验表明 SG1 定位于细胞质和细胞表面，而 SG2 定位于细胞质。 SG1 的过表达导致生长增加，而截断突变体的表达不会导致生长增加，因此有助于定义该蛋白质的功能域。最后，除了建立正向遗传学之外，我们还发现了不寻常的溶组织大肠杆菌 RNAi 途径的新细节。这些研究极大地提高了溶组织大肠杆菌的易处理性，并开辟了应用遗传学来提高对这一重要病原体的了解的可能性。

肿瘤发生与复发转移国际数据库描述：

 Entamoeba histolytica,forward genetics, deep sequencing analysis