【佳学基因检测】人类粪便细菌 DNA 百分比 G+C 组分文库的序列分析显示大量放线菌

基因检测多少钱解析

试图了解肠道微生物基因检测与肿瘤治疗的关系，阅读肿瘤检测的时间与空间对治疗效果的影响认识到《Blood》在 2017 Apr 27; 129(17): 2347–2358发表了一篇题目为《人类粪便细菌 DNA 百分比 G+C 组分文库的序列分析显示大量放线菌》肿瘤靶向药物治疗基因检测临床研究文章。该研究由Genetic abnormalities in myelodysplasia and secondary acute myeloid leukemia: impact on outcome of stem cell transplantation等完成。该研究成果通过JOURNAL CLUB, 内部研讨及文献的批判性阅读，使得佳学基因工作人员充分掌握了这一新出现的基因检测技术及临床应用范畴。

肿瘤靶向药物及精准治疗临床研究内容关键词：

胃肠道微生物群,多样性,GC百分比,16S rRNA,序列

肿瘤靶向治疗基因检测临床应用结果

背景：人类胃肠道 (GI) 道微生物群的特点是存在大量未培养的细菌，这些细菌最常见于厚壁菌门和拟杆菌门。尽管在几项研究中采用了独立于培养的技术，但这种微生物群的多样性仍然需要更多的阐明。这项工作的主要目的是研究在 16S rRNA 基因序列分析之前基于基因组百分比的鸟嘌呤和胞嘧啶 (%G+C) 的分析和分级是否揭示了更高的微生物群多样性，尤其是在高 G+C 细菌被认为代表性不足的情况下结果：通过将基于基因组 %G+C 的分析和分级与 16S rRNA 基因克隆和测序相结合，从汇集的粪便细菌 DNA 样本中对 23 名健康成人受试者的人类胃肠道微生物群组成进行系统发育分析.共测序了 3199 个部分 16S rRNA 基因。为了比较，从可比较的未分级样品中对 459 个克隆进行了测序。最重要的发现是与放线菌门相关的序列的比例数量在 %G+C 分级样品中为 26.6%，但在未分级样品中仅为 3.5%。 Coriobacteriales、Bifidobacteriales 和 Actinomycetales 目构成了分馏样品中的 65 个放线菌系统型，分别占该门内序列的 50%、47% 和 3%。结论本研究表明，克隆前的 %G+C 分析和分馏与人类胃肠道中未分离的样本相比，测序可以揭示回收的克隆中高 G+C 含量细菌的比例显着增加。特别是发现放线菌门内的科里细菌目比以前用传统测序研究估计的要丰富。

肿瘤发生与复发转移国际数据库描述：

gastrointestinal tract microbiota,diversity,GC percent,16S rRNA,sequence