【佳学基因检测】在乳腺癌细胞中获得多西紫杉醇耐药性期间外显子组的逐步进化

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根据肿瘤基因检测全面性的标准与实施方案知悉《Ann Oncol》在 2015 Aug; 26(8): 1589–1604发表了一篇题目为《在乳腺癌细胞中获得多西紫杉醇耐药性期间外显子组的逐步进化》肿瘤靶向药物治疗基因检测临床研究文章。该研究由Management of patients with advanced prostate cancer: recommendations of the St Gallen Advanced Prostate Cancer Consensus Conference (APCCC) 等完成。促进了肿瘤的精准治疗与个性化用药的发展，进一步强调了基因信息检测与分析的重要性。

肿瘤靶向药物及精准治疗临床研究内容关键词：

乳腺癌,多西他赛耐药,紫杉烷,外显子组测序

肿瘤靶向治疗基因检测临床应用结果

背景：乳腺癌患者对紫杉烷类治疗的耐药性是一个主要的临床问题，可以通过深入了解导致乳腺癌细胞对紫杉烷类药物耐药的基因组改变来解决。在目前的研究中，我们使用全外显子组测序来发现体细胞基因组改变，在乳腺癌细胞系中获得多西紫杉醇耐药性的过程中跨越进化阶段。结果：两种人乳腺癌体外模型（MCF-7 和 MDA-MB-231 ) 通过将细胞暴露于 18 种逐渐增加的多西紫杉醇浓度来开发逐步获得多西紫杉醇抗性的方法。在此过程中在五个连续阶段进行的全外显子组测序用于识别与获得多西紫杉醇抗性相关的单点突变事件、插入/缺失和拷贝数改变。使用基于网络的方法进一步优先考虑经历正选择和具有可能具有功能的特征的获得性编码变异。发现许多基因组变化正在进行进化选择，其中一些可能是功能性的。在抗性进展的五个阶段中，大多数抗性相关基因组变异似乎出现在完全抗性细胞的中间，对应于 MDA-MB-231 的第 31 代（5 nM 多西紫杉醇）和 MCF-7 的第 16 代（1.2 nM 多西紫杉醇），并且细胞也分别表现出生长速率降低或停滞的时期。 MCF-7 细胞在 7 号染色体上获得了多个拷贝数增益，包括 ABC 转运蛋白基因，包括 ABCB1 和 ABCB4，以及 DMTF1、CLDN12、CROT 和 SRI。对于 MDA-MB-231，在涉及 30 多个基因的 X 染色体上观察到大量拷贝数丢失。在这些基因中，CASK、POLA1、PRDX4、MED14 和 PIGA 被应用的基于网络的基因排序方法高度优先考虑。在较高的多西紫杉醇浓度下，MCF-7 亚克隆在 E2F4 中表现出拷贝数丢失，并且编码这一重要转录因子的基因在 MCF-7 抗性细胞中被下调。结论我们对获得性多西紫杉醇抗性进化的研究确定了几种可能的基因组变化解释多西紫杉醇耐药性的发展。有趣的是，最相关的抗性相关变化似乎起源于向完全抗性细胞系进化的中途。我们的数据表明，没有单一的基因组事件足以预测对多西他赛的耐药性，但需要影响多个途径的基因组改变共同建立最终的耐药阶段。电子补充材料本文的在线版本（doi:10.1186/s12864-016-2749-4 ) 包含补充材料，可供授权用户使用。关键词：乳腺癌、多西紫杉醇耐药性、紫杉烷、外显子组测序

肿瘤发生与复发转移国际数据库描述：

 Breast cancer, Docetaxel resistance, Taxane, Exome sequencing