【佳学基因检测】利用生物信息学分析基因检测确定肝细胞癌免疫浸润相关的治疗效果
肿瘤内科诊治策略基因检测价格降低策略
根据肿瘤内科诊治策略基因检测价格降低策略,国际著名基因检测科学性证据杂志《Medicine (Baltimore)》在第. 2021 Nov 12;100(45):e27739.期发表了一篇标题为《利用生物信息学分析基因检测确定肝细胞癌免疫浸润相关的治疗效果》的原创性研究文章。该基因领域的临床应用研究由Anamika Thalor, Hemant Kumar Joon, Gagandeep Singh, Shikha Roy, Dinesh Gupta完成。
基因信息数据库索引号:
JIAXUE GENETICS: 34766585和 doi: 10.1097/MD.0000000000027739.
基因解码研究关键词:
氯离子细胞内通道,肝细胞癌,治疗靶点,信号网络,晚期癌症
国际基因解码证据链条标签:
Key Words:Chloride intracellular channel,hepatocellular carcinoma, therapeutic target, signaling networks, advanced cancer stage
基因检测临床研究与应用结果介绍:
氯离子细胞内通道(CLIC)蛋白是一种具有6个家族成员的新型氯离子通道(CLIC1-6),已知其在神经、心血管、肺和听觉等多种生理功能中发挥关键作用,并在包括肝细胞癌(HCC)在内的各种恶性肿瘤中发挥关键作用。然而,在确定合适的CLICs作为HCC的治疗靶分子和预后生物标志物方面存在着相当大的挑战,因为可溶性或完整膜蛋白形式的转化以及不同CLICs的特定药理剂(激动剂和拮抗剂)仍然是个谜。为了解决这个问题以及肝癌中CLICs激活的可能分子基础和信号网络,我们使用ONCOMINE、UALCAN、GEPIA、cBioPortal和TIMER数据库检查了肝癌患者中CLICs的转录、启动子甲基化、DNA突变、生存率和免疫浸润数据。结果表明,CLIC家族成员在肿瘤组织和正常组织中的表达水平存在差异。CLIC1和CLIC3的高表达水平与肝癌患者的晚期癌症相关。低CLIC1表达与更好的总生存率(OS)相关。肝癌组织中CLIC1-3和CLIC5-6启动子的DNA甲基化水平明显低于正常组织。CLIC1改变患者的OS比CLIC1未改变患者的OS短。此外,CLICs的表达水平与6种不同免疫细胞(B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞)的浸润相关。这些结果表明,CLICs mRNA表达的增加和启动子DNA甲基化水平的降低可能在HCC的发生中起着至关重要的作用。CLIC家族成员的表达与肿瘤免疫状态显著相关。CLIC1和CLIC3的高表达水平可作为鉴别晚期HCC的生物标志物。此外,还观察到CLIC1突变率为18%,并且CLIC1基因改变与HCC患者的OS降低显著相关。
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