【佳学基因检测】男性生殖遗传学基因检测标准与专家共识
遗传病、罕见病基因检测导读:
本文内容最初发表于《中华男科学杂志》, National Journal of Andrology Zhonghua Nan Ke Xue Za Zhi 2015,21( 12) : 1138 - 1142。 转载于此是出于传播男性生殖遗传学的诊断标准,普及男性生殖的科学知识。并不代表本网站完全赞同和使用里面的知识和观点。
遗传学异常是临床上导致男性不育的重要因 素。随着生殖医学及男科学专业的发展,很多既往 认为只能供精辅助生育的患者,如 Klinefelter 综合 征等,有可能通过睾丸显微取精术行辅助生殖技术 ( ART) 助孕,这对临床传统治疗思路提出了挑战; 另外,新的检测技术发展迅速,为临床疾病病因诊断 提供了强有力的手段,但目前临床上存在着男性生 殖遗传学检查适应证不明确、方法良莠不齐、结果解 读及处理不规范等问题,为规范男性生殖遗传学检 查在临床中的应用,中华医学会男科学分会组织专 家共同研究并制定本共识,旨在为临床医师提供指 导和参考。
概述
遗传学检查在男性生殖疾病诊治中的应用非常 重要,开展男性生殖遗传学检查,对于指导临床治 疗、提高辅助生殖技术的疗效和安全性、开展胚胎植 入前遗传学诊断( PGD) 等具有重要意义,可选择染 色体核型分析、Y 染色体微缺失等常规检查以及基因突变检测等特殊检查。
遗传学检查技术发展突飞猛进,许多新技术逐渐用于临床,如多重连接探针扩增( MLPA) 技术可检测染色体数目异常、基因缺失和重复等; 基因多态性分析可预测男性不育患病风险并指导个体化用 药; 精子发生过程中涉及许多表观遗传学调控,检测 DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA( ncRNA) 等[1]; 近年来,具有高灵敏度、高通量、高分辨率等 特点的基因测序技术开始应用于临床,可检测一些基因组疾病,包括拷贝数变异( CNV) 等。比较基因 组杂交( CGH) 技术可用于检测某些不平衡的染色体畸变[1]。这些新技术的应用将进一步丰富男性生殖遗传学检查内容,为临床诊断和治疗提供参考。
1. 1 染色体核型分析
染色体核型分析是最常用的男性生殖遗传学检查技术。不育男性染色体异常发生率显著高于正常生育力男性。男方染色体核型 异常,如染色体平衡易位,与不育和配偶反复自然流产有关[2]。20 世纪 70 年代,高分辨 G 显带技术开 始在临床应用,目前已成为染色体核型分析的常规 检查方法[3]。荧光原位杂交( FISH) 技术可用于对 一些异常核型的明确诊断。
1. 2 Y 染色体微缺失检测
Y 染色体长臂上存在控制精子发生的基因,称为无精子因子( azoospermia factor,AZF) ; 1996 年 Vogot 等 将 AZF 分 为 AZFa、 AZFb、AZFc 3 个区域,1999 年 Kent 等认为在 AZFb 区与 c 区之间还存在 AZFd 区。AZF 的缺失或突变 可能导致精子发生障碍,引起少精子症或无精子 症[4]。Y 染色体微缺失目前主要是指 AZF 缺失,研究认为,在无精子症和少精子症的患者中,AZF 缺失者约占 3% ~ 29% ,发生率仅次于 Klinefelter 综合 征,是居于第 2 位的遗传因素[4]。目前,Y 染色体微 缺失的常用检测方法包括实时荧光定量 PCR 法、多 重 PCR-电泳法等[5]。
1. 3 基因突变检测
目前已知 CFTR( cystic fibrosis transmenbrane conductance regulator factor) 基因突变可引起 囊 性 纤 维 化 ( cystic fibrosis,CF; OMIM 219700) [6]和先天性双侧输精管缺如( Congenital Bilateral Absence of Vas Deferens,CBAVD; OMIM 277180) [7]。此外研究还发现它与慢性胰腺炎[8-10]、 睾丸生精功能障碍[11]、精子受精功能障碍[12]、女性生殖能力[13]等多种疾病相关,甚至与肿瘤的发生、 发展相关[14]。已有研究发现存在 CFTR 基因突变 的 CBAVD 患 者 ART 时有更高的流产、死胎风险[15]。AURKC 基因突变会导致大头多鞭毛精子 症[16],DPY19L2 基因异常会导致圆头精子症[17], 雄激素受体( AR) 基因突变会引起雄激素不敏感综 合征( AIS) [18],5α 还原酶( SRD5A) 基因突变可能会导致 46,XY 男性性发育异常[19]等。地中海贫血是 由于人类珠蛋白基因的突变引起,包括 α 和 β 两种 类型,α 地中海贫血的胎儿,在孕中晚期易出现宫内死亡或早产后死亡等不良妊娠结局; β 地中海贫血 可导致胎儿死亡或残疾[20-21]。针对广西、广东和海南等地中海贫血高发地区全体人群及曾生育过地中海贫血患儿的育龄夫妇,进行地中海贫血基因突变 检测,同时配合 PGD 或其他产前诊断可预防地中海 贫血患儿出生。因此,有必要针对上述患者进行特 定基因突变筛查和遗传咨询,指导临床治疗。
2 染色体异常
2. 1 检查指征及检测方法
当精子发生异常、性发育异常、配偶反复不良妊 娠、体 外 受 精-胚 胎 移 植 ( IVF-ET) 前准备以及一些特殊情形时,通常应进行 染色体核型分析,必要时行其他遗传学检查。染色体分析通常使用染色体显带技术来进行核型分析。
2. 2 染色体异常类型、临床表型及处理策略
染色体异常通常分为数目异常和结构异常。染色体数目异常包括染色体整倍体异常、性染色体数目异常和常染色体数目异常。男科临床染色体数目异常以性染色体数目异常为多见,常染色体数目异常较为少 见,而染色体整倍体异常者大都出生后死亡。本共识着重介绍性染色体异常的临床特征及处理策略。
2. 2. 1 Klinefelter 综合征( Klinefelter syndrome) 的 临床特征及处理策略
Klinefelter 综合征也称克氏 综合征或 XXY 综合征,是男性患者细胞中多出 1 条 X 染色体所致。多出的 X 染色体导致生精细胞发育障碍。位于 X 染色体上逃避 X 染色体的基因剂量效应可能是遗传病理之一。Klinefelter 综合征的常见核 型 为 47,XXY,占 80% ~ 85% ,嵌 体 ( 47,XXY/46,XY) 约 占 15% ,其 余 为 48,XXXY、 49,XXXXY等。患者通常身材高大( 与父母相比) , 第二性征发育异常,体征女性化,男性乳房发育,胡 须及阴毛稀少,阴茎小,睾丸体积小,睾酮低下和不 育。可伴有多种出生缺陷,如隐睾、尿道下裂、腹股沟疝、腭裂等。成年后易发生多种合并症,如糖尿病、代谢综合征、肥胖和骨质疏松等。Klinefelter 综合征的表型随着 X 染色体数目的增加而加重,主要表现在机体发育严重畸形和智力低下。
Klinefelter 综合征涉及多学科综合治疗,主要涉及生长发育及生育治疗。随着辅助生殖技术的发 展,许多 Klinefelter 综合征患者可通过辅助生殖技术获得子代。大多数 Klinefelter 综合征患者临床表 现为无精子症,少数患者可表现为隐匿精子症或重度少精子症,有些嵌合比例低的个体甚至可以有几 乎正常的精子发生,并有自然生育子代的报道。大 约 40% ~ 70% 临床表现为无精子症的非嵌合型 Klinefelter 综合征患者通过睾丸显微取精术能获得 精子,通过体外受精-胚胎移植生育子代[22-24]。
已有的研究表明,Klinefelter 综合征患者精子的异常核型从 0% ~ 21. 7% 不等,个体之间存在差异。 因此,大多数的精子核型是正常的,多数患者性染色体异常的精子比例低于 5% ,低于理论上的 50% 。 但考虑到 Klinefelter 综合征患者精子性染色体和常染色体异常的比例仍较正常生育人群高,其正常胚 胎的比例也较正常生育组低( 54. 0% vs 77. 2%) [25],必 要时建议考虑行 PGD 或产前诊断[25-27]。
2. 2. 2 47,XYY 综合征的临床特征及处理策略
47,XYY 综合征患者通常身材高大,智力正常或轻度低下,性格孤僻,易发生攻击行为,生育力正常至 无精子症均可发生。 47,XYY 理论上可形成 4 种类型的精子( X、Y、 YY、XY) ,但实际上异常核型精子比例很低,通常不超过 1% ,因此临床上通常按常规程序处理。
2. 2. 3染色体结构异常的分类及处理策略
常见的染色体结构异常有易位、倒位、缺失、重复、插入、 环状染色体、双着丝粒染色体和微结构异常等。导致染色体结构异常的遗传学基础是染色体的断裂和断裂后染色体断端的异常重接。随着分子细胞遗传学技术的发展,用常规的染色方法不能或难以被发现的染色体结构异常,也能得以发现并诊断。 当染色体结构异常患者产生不平衡精子时,多数胚胎通常很难存活,将导致流产或死胎。此类患者通常要借助辅助生殖技术,进行 PGD 生育子代。 某些染色体结构变异患者产生精子的情况与理论值有差异,如临床多见的 9 号染色体臂间倒位,其产生的正常核型精子比例通常较高,但也不能完全忽视产生异常胚胎的风险。
3 Y 染色体微缺失
3. 1 Y 染色体微缺失筛查指征、检测位点及方法
Y 染色体微缺失目前主要是指 AZF 微缺失。Y 染 色体上影响精子发生的 AZF 区域,可分为 AZFa, AZFb,AZFc 等区域。非梗阻性无精子症、严重少精 子症患者,建议进行 Y 染色体微缺失检测。原因不明的男性不育患者可选择性行 Y 染色体微缺失检测。AZF微缺失能垂直遗传,有相关家族史者,建议 进行筛查[4-5]。
目前,检测 AZF 微缺失推荐以下 8 个位点为包含位 点。sY84 及 sY86、sY127 及 sY134、sY254 及 sY255、sY145 及 sY152 [4-5,28-30]。
以前 Y 染色体 AZF 微缺失的临床实验室诊断方法是利用外周血标本行多重 PCR-电泳法,该技术耗时长,结果判定的主观性大,还存在交叉污染的风 险。随着技术的进展,建议应用实时荧光定量 PCR 技术,灵敏度高、特异性好、检测速度快,同时,必须加强临床检验过程中的质量控制[5]。
3. 2 Y 染色体微缺失的临床处理策略
3. 2. 1 AZFa 区域缺失
通常导致唯支持细胞综合征( SCOS) ,临床表现为睾丸体积的缩小、无精子症 等。AZFa 区域完全缺失合并无精子症者,建议供精人工授精( artificial insemination by donor,AID) 。
3. 2. 2 AZFb 区域缺失
患者睾丸组织病理学表现为精子发生阻滞,主要停留在精母细胞阶段,AZFb + c 缺失会导致 SCOS 或精子发生阻滞,患者多为无精子症,故 AZFb 完全缺失( 含 AZFb + c 缺失) 的无精子症者,建议供精 AID。
3. 2. 3 AZFc 区域缺失
单独AZFc 缺失患者可以表现为正常精子数目、少精子症及无精子症,AZFc 微缺失可以遗传给其男性后代。对于 AZFc 区缺失的无精子症患者,可以行睾丸手术取精获得精子行 ICSI。对于 AZFc 区缺失合并严重少精子症患者,可 以直接 ICSI,助孕时建议行 PGD 生育女孩,以避免 遗传缺陷的垂直传播。另外,有研究发现 AZFc 区域缺失的少精子症患者,其精子数目有进行性下降 的趋势,最后发展为无精子症。因此,对此类患者建议及早生育或冷冻保存精子。
3. 2. 4 sY145 及 sY152
有研究报道 sY145 及 sY152 可能与精子形态异常相关,缺失可能导致少精子症或者精子形态异常[28-29]。但目前尚缺乏国人大样本 ( 包括正常生育人群及无精子症患者) 的研究数据,故 sY145 及 sY152 的临床意义尚需进一步研究,建议参 考已发表的相关文献,对该位点与临床表型之间的关系及相应的睾丸组织病理学特征进行深入研究,为男 性不育患者提供更加全面的遗传学诊断。
4 CFTR 基因检测
4. 1 CFTR 基因突变检测指征
CBAVD 是男性不育和梗阻性无精子症的重要原因,患者除自觉精液量少之外多无其他症状,精液化验精液量少,pH 值低( < 6. 4) ,精浆果糖阴性,彩超多提示附睾网格状回声、附睾发育不良、双侧精囊腺发育不良等,少数病例合并肾脏发育畸形或缺如[14]。对于存在以上 情况疑诊 CBAVD 的患者建议进行 CFTR 基因检测。
4. 2 CFTR 基因检测方法
目前已知的 CFTR 基因突变有 2 000 多种,并且还在不断增加[31]。理想的突变检测方式是采集外周血对整个 CFTR 基因( 包 括启动子区) 进行测序。但限于目前还缺乏中国人群大样本的研究数据[32-35],建议可以先从已知突变位点着手开展,未来再借助高通量测序的方法更为全面、有效地检测出基因突变和多态性位点。
4. 3 CFTR 基因突变处理策略
如果男方存在 CFTR 基因突变,建议进行遗传咨询,避免子代的遗传学风险。
5 精子 DNA 完整性检测
精子 DNA 完整性是亲代将遗传物质正确传递给子代的前提,在受精和胚胎发育过程中发挥重要作用。精子 DNA 完整性检测反应了精子 DNA 的损伤程度,研究表明精子 DNA 的损伤与男性不育、自 然妊娠率的降低和反复流产可能有关[37-38]。临床 上引起精子 DNA 损伤的主要病因包括①精索静脉 曲张、睾丸炎、附睾炎和生殖器肿瘤等疾病; ②激素、 放、化疗药物及免疫抑制剂等药物的使用; ③抽烟、 酗酒等不良生活习惯及农药、重金属等环境污染物; ④年龄或心理因素等[39]。
5. 1 精子 DNA完整性检测的适应证
①女方反复 自然流产、胚胎停育等的男性不育患者; ② 采 用 ART 多次未成功的男性不育患者; ③排除女方因素 的特发性男性不育患者( 无精子症除外) 推荐进行; ④大龄、拟行 ART 助孕者及育前优生体检者可选择 性检查。
5. 2 精子 DNA完整性检测方法
由于目前检测方法较多,且各有优劣。常见技术包括精子染色质结构分析试验( SCSA) 、彗星试验/单细胞凝胶电泳 ( SCGE) 和精子染色质扩散试验( SCD) 、荧光原位杂 交技术( FISH) 等[40]。SCSA 法成本相对较高,且需 要使用流式细胞仪检测,对实验室条件要求较高,但检测中分析5 000条精子,能更加稳定准确地反映精子 DNA 损伤的真实状态; SCD 法只需使用光学显微 镜,检测快速且成本相对较低,但检测结果易受主观 分析影响,检测人员的经验和熟练程度尤为重要。 目前使用流式细胞仪进行 SCSA 法使用相对较多。
5. 3 精子DNA完整性检测的结果解 读
目 前 SCSA、FISH 及 SCD 等方法使用相对较多。对于精DNA 完整性检测的结果上,使用精子 DNA 碎片指数( sperm DNA fragmentation index,DFI) 高低来 表示,目前一般认为: DFI≤15% 为正常,15% < DFI < 30% 为一般,若 DFI≥30% 认为完整性较差,可能会影响妊娠结局[41-42]。
5. 4 精子 DNA 完整性检测结果的临床处理策略
针对高 DFI 患者,建议其改善不良生活习惯,避免接 触吸烟、酗酒、药物等生殖毒性物质和桑拿等过高热 环境; 服用抗氧化剂,如维生素的补充; 如有感染进行抗感染治疗; 针对病因的手术治疗,如精索静脉曲 张结扎术等。 总之,男性生殖遗传学检查对于指导临床诊疗 有重要意义,生殖遗传学检查的指征及处理策略需 要在临床中进一步规范及完善,尽管还存在不同学术观点,但随着检测技术飞速发展及更多临床研究 的开展,生殖遗传学检查在男科领域内的应用将更 为规范。
编写组成员名单 顾 问: 姜 辉 邓春华 组 长: 商学军 成 员: ( 排名不分先后) 谷翊群 黄 锦 刘德风 陈 亮 史轶超 夏欣一 杜 强 唐文豪 高 勇 崔英霞 洪 锴 孙 斐 执 笔: 陈 亮 夏欣一 刘德风
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( 收稿日期: 2015-11-25; 接受日期: 2015-11-27)(责任编辑:佳学基因)